
聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析:
聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析,應用Hungate厭氧技術,從大慶油田采油五廠十三區聚合物配注站的母液罐中分離到一株聚丙烯酰 胺降解菌株CMW,該菌株為G+,杆狀,黑色圓形菌落,最適溫度為38 °C,最佳jH為7. 8^具有硫酸鹽還原功 能,產H2S嚴格厭氧.研究表明,該菌株能以聚丙烯酰胺為唯一碳源,降解側鏈,部分官能團發生改變,質量 濃度為500mg/L時菌株具有較高的聚丙烯酰胺降解能力,其溶液黏度下降效果顯著.通過形態、生理生化、 16S rDNA以及16S~ 23S DNA間隔區序列鑒定,可能為梭菌屬的新種,暫時命名為Cfostridium. sticklondii CMWf(G«iBank登錄號為DQ011249). 16SJRNA基因序列較為保守更適合屬間的鑒定,16S~23S DNA間隔 區序列包含tRNAIle* tRNAAk基因,更適合屬內種間鑒定.
2.2 CMW菌株對聚丙烯酰胺的降解
2. 2 1 CMW菌株對聚丙烯酰胺黏度的改變 〇 PCR反應在pTC- 200上進行擴増,20LL的近年來,國外研究者發現聚丙烯酰胺的降解
烴、膠質及瀝青質)與水之間流度比下降,減弱水 的黏性指數,從而提高原油采收率[1].聚合物驅 油的采出液中,不僅含有原油,而且還含有聚丙烯 酰胺,含聚丙烯酰胺的汙水是一類比較複雜、特殊 的汙水,具有含油多,黏度大的特點[2-3].尋找能 產生還原性物質的微生物,促進聚丙烯酰胺的連 鎖氧化降解反應,從而完成聚丙烯酰胺的降解,是 解決含聚汙水外排的重要途徑,聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析,目前有關聚丙烯 酰胺降解的微生物報道很少.
試驗從大慶油田聚合物配注站的母液罐中篩 選出了降解聚丙烯酰胺的硫酸鹽還原功能菌株, 進行生理生化、16S DNA序列和16S~ 23S iDNA 間隔區序列克隆測序,對其係統發育進行分析,同 時對聚丙烯酰胺降解進行初步研究.
1材料和方法
1.1菌種的來源、實驗材料
菌種來源於大慶油田五廠十三區聚合物配注 站,取樣點為注入工藝母液罐中的聚合物水溶液 (8000mg/L 洱=7.8~8.0).
采用Hungate厭氧操作技術、絕跡稀釋法[4] (MPN)以及/滾管”培養對樣本進行分離,多次純 化獲得純菌株CMW.具體方法:向改良後Starkey 培養基(K2HPO4 0■ 5 g,NH4C 11.0 g Na2S〇4 2 g CaCl. 2H2O 0■ 1 g MgSO4 • 7H2O 2. 0 g 酵母膏 1.0 g 60%的乳酸鈉溶液6 mL蒸餾水1000 mL 7 8)中加入0.2%的刃天青溶液,培養基煮 沸後,加入L-半光鹽酸鹽0. 5 g通入高純氮氣 驅氧 30mi,121 °C 滅菌 20min 3% 的 FeS〇4 • (NH4)2 SO4溶液單獨加入,固體培養基加入 1. 6%的瓊脂糖.CMW菌株於液體培養基中38 °C 培養48 h後,在光學顯微鏡(O ympus COVER - 018)下革蘭氏染色觀察,透射電鏡(H2600A,H- TACHI)下觀察菌體的形態和結構.按簡明第八 版伯傑氏細菌鑒定手冊》進行生理鑒定.
1. 2 16S IDNA和 16S~ 23S IDNA 間隔區序列 的克隆與測序
用試劑盒(寶生物公司)提取菌株DNA,采用 通用引物進行PCR擴増,16S iDNA序列的引 物[5] Eubac27F: 5' - AGAGTTTGATCCTGGCT- CAG- 3.,1492R: 5. - GGTTACCTTGTTACGACTT -3’; 16S~ 23S DNA 間隔區的引物[6] P1 5’ - GGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA- 3’, P2 5’ - CCTCTGACTGCCAGGGCATCC- 3’;引物由大連 寶生物有限公司合成.
反應體係內含:模板40 ng左右,TagDNA聚合酶 (大連寶生物)終濃度為0■ 3 U,dNTP為 0. 3mmo1/L引物各0. 1 Lmol/I;擴増程序為: 94 °C預熱 5 m n 94 °C變性 30 s 58 °C複性 45 s 72 °C延伸90 s循環30次,最後72 °C延伸 10m in擴増產物與1. 0%的瓊脂糖電泳檢測.用 膠回收試劑盒(寶泰克)切膠回收,後與pGEM - T (Piomega)載體連接,轉化到大腸杆菌TOP10感 受態細胞(天為時代).LB固體培養基中加入氨 苄青黴素Amp(5Lg/mL)和X- gal藍白斑篩選 轉化子.提取質粒(華舜),用載體引物T7和SP6 檢測.測序由上海生物工程有限公司完成.
將測得的 16S iDNA、16S~ 23S iDNA 間隔 區序列在GenBank進行Blast對獲得的同源序 列進行序列分析.用BbEditv5.06進行多序 列比對,采用MEGA3.1軟件中的鄰接法構建 進化樹.
1.3分析方法
硫化氫氣樣采用Sp- 2000型氣相色譜儀進 行分析,FPD檢測器,聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析,柱溫60 °C,以25% B,B -氧 二丙晴為固定相;液相末端產物分析:中國產 GC112型氣相色譜儀,氫火焰離子檢測氣,測定條 件(擔體 GDX- 103(60- 80 目)+ 2%H3P〇4,填 充柱長2 m x <5 mm,載氣N;進樣量2 LL);聚 合物濃度:澱粉-碘化鎘法;聚合物黏度測定,采 用H akke Bush黏度儀,恒溫水浴45 °C,轉子轉速 6 r/min;聚丙烯酰胺幹粉、水作用後的聚丙烯酰 胺以及微生物降解產物幹粉,經KBr壓片,采用 紅外光譜法(Spectrum One FFR,PE)進行分析.
2結果與分析
2.1形態和生理生化鑒定
CMW菌株為杆菌,長度在0.4~ 0. 6 Lm x 0. 6Lm~ 3. 0Lm,G+,無芽孢,能運動,有4根鞭
毛(圖1).在含有亞鐵鹽的乳酸鹽-硫酸鹽固體 培養基中形成黑色圓形菌落,表麵凸起、光滑,邊 緣整齊.利用硫酸鹽、亞硫酸鹽和還原性硫化物起 電子受體作用,並還原成H2S保留時間為0. 323 (圖2),嚴格厭氧.碳源為乳酸鈉、蘋果酸、葡萄 糖、琥珀酸、酵母膏和蛋白腖的培養基中生長.不 同碳源作為底物中生長狀況各異,在酵母膏中生 長最好.能以硫酸氨、尿素為氮源.液相末端產物 為乙酸、丙酸、丁酸、乙醇.
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產物可作為細菌生命活動的營養物質,細菌對降 解產物的消耗促進聚丙烯酰胺的降解.選用抗鹽 聚丙烯酰胺(KYPMA1600),代替乳酸鈉作為碳 源,用蒸餾水配製成不同質量濃度聚丙烯酰胺 (50 mg/L、 100 mg/L、 150 mg/L、 200 mg/L、 400mg/L、 600 mg/L、 800 mg/L、 1000 mg/L、 1200mg/L)培養基,滅菌後加入3%»維生素C;作 為還原劑消耗經過高壓滅菌產生的自由基|71,接 種量為10%.接種後54 h記數的結果表明,聚丙 烯酰胺質量濃度在400~ 800mg/L時細菌數量較 大,最適宜的質量濃度為600 mg/L由圖3可見, 質量濃度為600mg/L時CMW菌株生長曲線和 聚丙濃度變化,在培養後的36 h進入對數生長 期,72 h後進入穩定期.特別是進入對數生長期 聚丙濃度降低較快.同時選擇4個點測定了聚丙 烯酰胺溶液黏度,黏度變化較大,由接種時的 18. 5mPa•到第 48 h的 8. 6mPa. s 至第 168 h 的3.4mPa. s第480h的1.1mPa. s該菌株對 於降低黏度效果顯著.
生長曲線
CMW菌株的透射電鏡照片(
50000)
0.260.280.30 0.320.34 0.360.38
t/min
圖2 H2S氣體在氣相色譜中的保留時間
•聚合物濃度
培養時間/d
圖3 600mg/L時CMW菌株的生長曲線和聚丙濃度變化
2.2 2 CMW菌株對聚丙烯酰胺結構的改變
聚丙烯酰胺降解產物中,低相對分子質量化 合物除含雙鍵、環氧和羰基的聚丙烯酰胺碎片外, 聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析,大多屬於一般丙烯酰胺低聚體的衍生物.由圖4 可見,水作用後的吸收峰與幹粉樣品相比出現新 的峰值,1567. 32峰代表羰基,3433. 22峰代表N -C鍵斷裂;菌株作用後,相對於樣品和水溶液, 在620. 36到1298. 76峰值是各種不同的苯環結 構,多為菌株降解的產物.表明CMW菌株以聚丙 烯酰胺為碳源和氮源,降解側鏈,部分官能團發生 改變,導致聚丙烯酰胺斷鏈和溶液黏度下降.
2. 3 16S lDNA 序列和 16S~ 23S lDNA 間隔區 序列係統發育學分析
經測序後獲得1536bp的16S iDNA序列, GenBank登錄號為DQ011249,序歹J在GenBank中
進行比對,挑選同源序列分值較高的有代表性菌 株,以Therm o togasp. ( A J872271 )、
Desuforh〇pa1us vacuo latus ( DSRRG )為參比菌 株,采用NJ法構建係統進化樹.
由圖5可見,係統發育樹中參比菌株與其他 參試菌株明顯地分開,14個菌株的平均遺傳距離 為0. 1790(方差為0.0079). 16S iDNA序列比對 的結果表明,CMW 菌株與 Clos/ridium. stick land ii (CLORRSA)的相似性水平達98%,該菌株分離 自生產氨的廢水中,而CMW菌株分離自純聚合 物的母液罐中,能以聚丙烯酰胺為唯一碳源,不發 生毒害作用,並且具有硫酸鹽還原功能,結合菌株 的形態和生理生化特性,初步鑒定可能為梭菌屬 的新種,暫時命名為Clos/ridium. stick land ii CMW.獲得16S~23S DNA間隔區序列長度為 346bp 隻有 Thermo toga .sp.( AJ872271 ),
Methylobacterium ex/orquens (AF293375)同時具 有16S DNA和間隔區序列,相似性分別為70%, 79%,與 P. iwicus (PI16SRRNA)相似性為 98%.研究表明,16SiRNA基因序列更為保守些,
rRNA之間的基因間隔區因為沒有特定功能,進 化速率比16S iRNA大10多倍[8],更加適合屬內 種水平上的鑒定.革蘭氏陽性細菌多編碼RNAAk 或RNA'革蘭氏陰性細菌根據間隔區的片段長 短不等編碼 RNA(;i1, RNALys 和 tRNAVa, RNAAk、tRNAu和tRNA(;k,還有部分間隔區根本
不含tRNA基因[9-11].本菌株排列方式16S iRNA -RNAIfc- RNAAk- 23S RNA,含有兩個 tRNA 基因,即 tRNA11'和 tRNAAk.與 Themotoga (AJ872271 ),M ethylobacteriumex torquens
(AF293375)具有相同的基因結構.
圖5基於CMW菌株和相近的菌株16S rDNA序列構建的NJ係統發育樹
3結論
1)應用Hungate厭氧技術分離到的CMW菌 株,為杆菌,長度在0■ 4~ 0-6 Lm @ 0. 6 Lm ~
3.0 Lm,G+,無芽孢,能運動,有4根鞭毛,具有硫 酸鹽還原功能,產H2^嚴格厭氧.
2)(MW菌株能以聚丙烯酰胺為唯一碳源,降解
側鏈,其部分官能團發生改變,聚丙烯酰胺溶液黏度 下降效果顯著,聚丙烯酰胺降解菌株分離及其係統發育分析,具有較高的聚丙烯酰胺降解能力.
3 ) CMW 菌株與 Cbstridium. stickkindii (CLORRSA)的相似性水平達98%,結合菌株的 形態和生理生化特性,初步鑒定可能為梭菌屬的 新種,暫時命名為 Clostridium sticklandii CMW.
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